観測用CCDの読み出しはバックエンドエレクトロニクス(BEE)とフロントエンドエレクトロニクス(FEE)で行います．HSCは全116個のCCDに合計464個の信号出力があり，FEEはこれらのCCD制御と読み出しを行います．微弱な星の光を光子5個程度の精度で測定することができます．またBEEは1枚約2GBの画像を10秒間隔で連続して取得することを可能にしています．これらのエレクトロニクスシステムの設計開発は，すばる望遠鏡の観測装置開発の経験を生かしながら，ATCにおいて東京大学と高エネルギー加速器研究機構(KEK)と共同開発されました．